您提出的“租了两个房子，备案登记用哪个”的问题，需结合相关法律规定明确依据。
根据《城市房地产管理法》第五十三条（2007年修正版）规定：“房屋租赁，出租人和承租人应当签订书面租赁合同，约定租赁期限、租赁用途、租赁价格、修缮责任等条款，以及双方的其他权利和义务，并向房产管理部门登记备案。” 同时，《商品房屋租赁管理办法》第十四条规定：“房屋租赁合同订立后三十日内，房屋租赁当事人应当到租赁房屋所在地直辖市、市、县人民政府建设（房地产）主管部门办理房屋租赁登记备案。”
从上述法律条款可知，备案登记针对的是单个房屋租赁合同，即每一套租赁房屋对应一份备案。您租了两套房子，若两套均需备案，应分别办理；若仅需备案其中一套，可选择实际居住或有特定需求（如子女入学）的那套，提交该套的租赁合同、房东身份证明、房产证等材料办理备案。法律未强制要求租赁多套房屋时必须全部备案，但备案的房屋租赁关系受法律保护，未备案的可能存在权益风险。
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您租了两个房子，备案登记时需结合租赁需求和法律要求选择。
您可根据实际居住需求或租赁用途选择其中一套进行备案，也可两套都备案。
1. 若您仅实际居住其中一套，可选择该套办理备案，备案后该套租赁关系的合法性和权益保障更明确；
2. 若两套均用于居住或经营，且当地政策允许，可同时对两套房子分别办理备案；
3. 若您作为承租人需通过备案享受相关公共服务（如子女入学），应优先选择实际居住的那套办理备案。
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租了两个房子选择备案登记时，需避免以下常见错误操作。
1. 仅备案一套却用另一套申请公共服务：部分承租人备案A套房屋，却用B套房屋的租赁信息申请居住证或子女入学，导致材料不符，无法享受服务；
2. 未与房东沟通直接选择备案：选择某套房屋备案前未与房东确认，导致房东拒绝提供房产证等材料，无法完成备案；
3. 同时备案两套却提交错误材料：若同时备案两套，需分别提交每套的材料，部分承租人误将两套材料混在一起提交，导致备案失败。
若您曾出现类似错误操作，或担心后续备案出现问题，可进一步向律师咨询，获取专业的备案指导。
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租了两个房子选择备案登记时，可能存在以下特殊情况或例外情形，影响处理方式。
1. 其中一套房屋为群租房或违规隔断房：若某套房屋是群租房或违规隔断房，根据《商品房屋租赁管理办法》第八条规定，违规隔断的房屋租赁合同可能无效，无法办理备案。此时您需选择另一套合法合规的房屋备案，若两套均为违规房屋，需及时与房东协商解除合同，重新租赁合法房屋；
2. 两套房屋属于同一房东且房东同意合并备案：极少数情况下，若两套房屋属于同一房东，且房东同意将两套房屋的租赁信息合并为一份合同（需明确两套房屋的租赁期限、租金等），部分地区房管部门可能允许合并备案，但需提前咨询当地政策。若合并备案，需确保合同条款明确，避免后续纠纷；
3. 当地政策要求租赁多套房屋需全部备案：部分地区为加强租赁管理，要求承租人租赁多套房屋时需全部备案，若您仅备案其中一套，可能面临房管部门的整改通知或罚款。此时需按当地政策要求，及时补充未备案房屋的备案材料。

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